Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd2E9PZM4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd2E9PZM4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms