Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brd1E9PZ26 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms