Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp4E9PYK3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms