Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc144bE9PVZ3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms