Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl3E0CZ16 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms