Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh8D3Z6W3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh8D3Z6W3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms