Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5478D3Z6R0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms