Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms