Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms