Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfbr3lD3YZZ2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms