Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc6D3YZP9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc6D3YZP9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms