Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc170D3YXL0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc170D3YXL0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms