Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SafbD3YXK2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms