Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms