Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nlrc5C3VPR6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms