Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna7C0LLJ0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms