Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmf1B9EKI3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms