Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cttnbp2B9EJA2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms