Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm6133B2RY53 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms