Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnldc1B2RXZ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms