Protein–RNA interactions for Protein: B2RX14

Zcchc11, Terminal uridylyltransferase 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc11B2RX14 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zcchc11B2RX14 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc11B2RX14 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms