Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms