Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprbB2RU80 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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