Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt4B2RU40 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms