Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otud4B2RRE7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms