Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf1B2RRD7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms