Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zbed5B2RPU8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed5B2RPU8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms