Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms