Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Spocd1B1ASB6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spocd1B1ASB6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms