Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PtprsB0V2N1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprsB0V2N1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms