Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint5A7XUY5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms