Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4aA2BI40 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms