Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2al1jA2BFR3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2al1jA2BFR3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms