Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb1A2AQ07 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms