Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms