Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ttll9A2APC3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttll9A2APC3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms