Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cavin4A2AMM0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin4A2AMM0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin4A2AMM0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cavin4A2AMM0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms