Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SetxA2AKX3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SetxA2AKX3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SetxA2AKX3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SetxA2AKX3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SetxA2AKX3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SetxA2AKX3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms