Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap5A2AGT5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap5A2AGT5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap5A2AGT5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap5A2AGT5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap5A2AGT5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap5A2AGT5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap5A2AGT5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap5A2AGT5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap5A2AGT5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap5A2AGT5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap5A2AGT5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms