Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc163A2AGD7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms