Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms