Protein–RNA interactions for Protein: A2AE21

Zfp300, Zinc finger protein 300, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp300A2AE21 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp300A2AE21 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp300A2AE21 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp300A2AE21 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp300A2AE21 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp300A2AE21 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp300A2AE21 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp300A2AE21 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms