Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms