Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930469K13RikA0A286YDB2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930469K13RikA0A286YDB2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms