Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms