Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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