Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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