Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Speer3W4VSP1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Speer3W4VSP1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms