Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc166S4R181 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms