Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt6bQ9Z331 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms